溫室內由于常年不間斷的進行作物栽培，病害防治難度較大，需要有叫多的經驗及較高的專業知識掌握，管理主要需要注意以下幾個方面。
1、水培的種植槽及營養液循環系統要定期進行消毒，一般三至四個月就需要消毒一次，屆時需要將作物全部移除，用清水將栽培槽及營養液循環系統全部沖洗干凈，在使用百分之一的高錳酸鉀溶液循環消毒兩天，最后排出消毒液之后用清水沖洗整個系統。
2、基質栽培每栽培完一茬，為了減少病害，就需要對基質進行消毒一次，消毒時使用甲醛一百倍液淋濕基質，之后使用薄膜將基質包好，四十八小時后打開薄膜，深翻基質，兩到三天后即可繼續使用。
3、觀光溫室再設計時，要將現代農業與藝術進行有機融合，往往溫室內藝術造型眾多，各種不同的栽培架琳瑯滿目，所以在栽培作物時，就要進行綜合考慮如何布置才能達到瓜果滿棚的效果。
4、可供選擇的有大量瓜類，巨型南瓜、玩具南瓜、麥克風南瓜等，結果時大小不一，琳瑯滿目，色彩繽紛。冬瓜、絲瓜、等也是主要栽培的品種，安排得當可以使溫室內四季常綠，一定要突出栽培品種的新、奇、特的特點。
5、觀光溫室近些年才在我國興起，其結合高科技無土栽培、科普教育、品種示范于一體。觀光農業溫室要求品種多樣，要有較強的觀賞性，溫室需要一年四季充滿綠色，所以在栽培管理時，就需要格外注意。
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